三好学生通常颁发的证书是 荣誉证书。具体颁发情况如下：
中学三好学生
由负责评选的教育部门和学校分别授予三好学生证书。
证书由教育部统一规格，省、市、自治区教育厅（局）负责印制、颁发。
大学三好学生
大学三好学生没有奖状，只有一个证书。
证书是荣誉称号，用于表彰在思想、学习、生活等方面表现优秀的学生。
大专三好学生
大专院校在评选三好学生时，除了开会表彰外，一般还会发给获者证书或奖状。
综上所述，无论是中学、大学还是大专，三好学生都会获得由相应教育部门或学校颁发的荣誉证书，以表彰其在学业、品德等方面的优秀表现。
