《风色幻想5》的剧情是一个全新的开始，与以往的风色系列游戏在剧情上没有直接联系，但在深度和细腻度上仍然有着宏大的设定。游戏的故事背景设定在一个被天上诸神降下灭世神罚的遥远过去，人类因滥用假学科技污染大地而面临灭绝的危机。在这个绝望的时刻，七名被后世称为贤者的人出现了，他们带着赎罪之心，经历了赤与蓝之神的严格考验，并在几乎牺牲自己生命的试炼即将结束时，得到了与诸神沟通的机会。
七贤者中的引导者伊札克代表人类向诸神承诺，不再利用假学力量污染大地，并以自己的生命为代价，将假学科技永远埋葬。他们的牺牲感动了天上诸神，尤其是慈爱的现世之神盖亚，她取代了代表毁灭的神罚赫尔梅斯，降临大地，复苏了世界。在神之机关埃尔汀的运转下，人类得到了无垢能源，并在女神的守护下重新复兴。
游戏的主人公是弥赛亚的冒险猎人，他们以人与自然的关系以及世界上不同存在的暗夺为线索，展开了一系列的冒险故事。其中，莉可、艾因、梅鲁、希亚等人是故事的主要角色，他们在冒险的过程中经历了各种事件和挑战，最终为了拯救世界做出了巨大的牺牲。
此外，游戏还有多种不同的结局，这些结局取决于玩家在游戏中的选择和行动。不同的结局会导致不同的角色命运和世界的未来。
总的来说，《风色幻想5》是一款以深邃寓言和宏大世界观为背景的角色扮演游戏，通过丰富的剧情和角色发展，带给玩家深刻的感动和游戏体验。
