蔡元培的教育思想主要包括以下几个方面：
教育目的与理念
蔡元培认为教育的根本目的在于培养具有完全人格的人，即德、智、体、美、劳全面发展的人。
强调教育不应仅仅局限于知识的传授，更应关注人的全面发展，包括道德品性的提升、智力潜能的激发、身体素质的增强、审美情趣的培养以及劳动技能的学习。
提出“教育独立”主张，认为教育应独立于政治、宗教之外，成为国家和社会发展的支撑。
主张教育应面向全体学生，无论贫富、贵贱，都应享有平等接受教育的机会，体现教育公平的理念。
德育为先
蔡元培认为德育是教育的核心，是塑造完全人格的关键。
提倡“以美育代宗教”，认为美育能够陶冶性情、净化心灵，是德育的重要补充和升华。
注重培养学生的公民意识和社会责任感，因为教育的最终目的是培养能够担当社会责任、为国家和社会做出贡献的公民。
“五育”并举的教育方针
提出军国民教育、实利主义教育、公民道德教育、世界观教育和美感教育。
军国民教育强调体育和军事训练，实利主义教育注重科学文化知识的学习和职业技能的培训，公民道德教育着重于道德品性的培养，世界观教育培养超越现象世界的观念和精神境界，美感教育即美育，作为德育的补充。
高等教育改革
蔡元培任北京大学校长时，提出大学的性质在于研究高深学问，提倡学术自由，科学民主。
主张学与术分校，文与理通科，将“学年制”改为“学分制”，实行“选科制”，精简课程，力主自学，校内实行学生自治，教授治校。
蔡元培的这些教育思想和实践，对中国现代教育体系的建立与发展产生了深远的影响
