《大漠谣》的结局如下：
霍去病与金玉隐居：
霍去病在战场上中了两箭，其中一箭是孟九配置的假死药，另一箭是另有他人配的毒药。孟九为了救霍去病，以身试毒，最终配置出解药，使霍去病的毒得以解除。两人成功隐居，过上了幸福的生活。
孟九的牺牲：
孟九在试毒过程中，因不知道哪一箭是假死药，最终导致双腿永久残废并且萎缩。他为了救霍去病，没有告知金玉真相，而是选择独自离开，只留下一封信。
其他角色的命运：
李夫人最终病死，而石舫的主人退出竞争，帮助霍去病和金玉带他们的第一个小孩。
综上所述，电视剧《大漠谣》的结局是霍去病与金玉最终在一起，过上了隐居生活，而孟九则因试毒导致双腿残废，最终离开。
