北京地铁没有3号线、11号线和12号线的原因主要可以归结为 规划调整或其他原因。
3号线
规划暂停：根据2017年的信息，3号线的规划已经暂停，并且与6号线合并。
建设延迟：3号线虽然处于建设阶段，但由于人口增长和规划调整，导致多次推迟，预计在2023年通车。
其他线路冲突：由于与其他地铁线路的冲突，3号线的建设计划被搁置。
11号线
暂无规划：在2004-2015年的近期轨道交通规划中，11号线并未被规划在内。
12号线
暂无规划：同样在2004-2015年的近期轨道交通规划中，12号线也未被规划在内。
综上所述，北京地铁没有3号线、11号线和12号线主要是由于规划调整或其他原因，导致这些线路未能按计划建设或纳入早期的规划。
