莱布尼茨被康熙拒绝的原因主要在于康熙皇帝认为中国已有足够的文化和科学技术,不需要外国科学家的加入或建立科学院。康熙皇帝觉得中国文化博大精深,对微积分等数学概念的研究中国古代已经不落后于西方,甚至在某些方面领先。因此,他并不认为有必要从外国引进科学。此外,康熙可能还出于维护国家主权和本土文化的考虑,不愿意接受一个外国科学家在其统治下的中国建立科学院。
这一决定最终导致中国错失了学习西方先进科学的机会,这在一定程度上影响了中国的科技发展和现代化进程。如果康熙皇帝当时接受了莱布尼茨的提议,中国可能会有机会系统地学习西方科学,并可能在此基础上实现更快的技术进步和经济发展。