如果户口迁移证没有及时上交并已经失效，可以采取以下步骤处理：
咨询当地派出所户籍部门：
首先，您需要联系户口迁移证原先开出地的派出所户籍部门，说明情况并咨询具体的处理方式。如果过期时间不长，派出所可能会直接为您办理落户手续；如果过期时间较长，则可能需要返回原派出所重新改签。
返回原派出所重新改签：
如果需要重新改签，您需要携带过期的户口迁移证、未落户证明以及身份证，返回到户口迁移证派发的派出所，请求他们为您改签到原籍。这个过程通常比较简单，您本人亲自带着上述材料直接办理即可。
重新办理户口迁移证：
如果因为某些原因未能及时落户，且户口迁移证已经过期，您可以按照《中华人民共和国户口登记条例》第十三条的规定，在取得迁入地公安局或派出所同意的情况下，按照指定的迁移方向开具新的户口迁移证。
及时更新身份证：
如果您的户口迁移证即将到期，建议您及时办理身份证更新手续，以确保户口迁移证的正常使用。
通过以上步骤，您应该能够解决户口迁移证失效的问题，并成功办理落户手续。
