EM菌，即 Effective Microorganisms的英文缩写，中文意思是 有效微生物菌群。它是由光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、放线菌群、丝状菌群等10属80余种微生物组成的生物制剂。EM菌具有结构复杂、性能稳定、功能齐全的优势，对土壤恶化、连作障碍、作物的抗病抗逆能力、产量和品质等有着积极的作用。
EM菌由日本琉球大学的比嘉照夫教授于1982年研究成功，并在80年代投入市场。它是一种混合菌，一般包括光合菌、酵母菌、乳酸菌等有益菌类，可用于食品添加、养殖病害防治、土壤改良、生根壮苗、污水治理等多个领域。
EM菌的作用机理是通过形成EM菌和病原微生物争夺营养的竞争，由于EM菌在土壤中极易生存繁殖，所以能较快而稳定地占据土壤中的生态地位，形成有益的微生物菌的优势群落，从而控制病原微生物的繁殖和对作物的侵袭。这种技术被认为是生态农业的发展方向，有利于农业的可持续发展。
总之，EM菌是一种由多种有益微生物组成的生物制剂，具有广泛的应用前景和显著的生态及经济效益。
